Основными задачами отделения являются:

- Наблюдение за состоянием здоровья детей и обеспечение нормальных санитарно-гигиенических условий жизнедеятельности.

-   Выявление степени соматических, неврологических и психических расстройств у детей.

-   Разработка индивидуальных лечебно-реабилитационных программ для несовершеннолетних.

Основными направлениями деятельности отделения являются:

1. Ежедневный осмотр воспитанников Центра.
2. Ежемесячные антропометрические измерения (рост, вес) детей и сравнительный анализ.
3. Осуществление забора анализов для серологического и микробиологического обследования и анализов напряженности иммунитета к вакциноуправляемым инфекциям, поступившим детям без медицинской документации.
4. Проведение в Центре плановой вакцинации воспитанников в соответствии с Национальным календарем профилактических прививок и сезонной вакцинации против гриппа воспитанников и сотрудников Центра.
5. Проведение плановой диспансеризации воспитанников Центра (весна-осень).
6. Подготовка медицинской документации для перевода детей Центра в детские дома, в детские оздоровительные и специализированные детские санатории.
7. Проведение летней оздоровительной компании.
8. Профилактика простудных и вирусных заболеваний у воспитанников в осенне-зимний период.
9. Проведение санитарно-просветительской работы с воспитанниками и сотрудниками Центра.
10. Наблюдение за состоянием санитарно-эпидемиогического режима в учреждения, режима и качества питания.